Agirre Center nace en 2013 de la tesis doctoral sobre la experiencia vasca de transformación social y económica llevada a cabo por el Lehendakari Juan Jose Ibarretxe: Principio Ético, Principio Democrático y Desarrollo Humano sostenible: fundamentos para un modelo democrático” (2010).

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Dicha investigación relata cómo a finales de la década de los 70 Euskadi se hallaba inmersa en una profunda crisis económica, con altas tasas de paro y una imagen internacional directamente asociada a la violencia terrorista. Sin embargo, a través del autogobierno, de la colaboración público-privada, del desarrollo institucional o la clusterización Euskadi ha conseguido situarse entre los primeros puestos de los rankings de bienestar y forjarse una imagen asociada a la competitividad y al desarrollo humano sostenible.